29 listopada 2007 r. Prezydent Rzeczypospolitej Polskiej Lech Kaczyński wręczył Annie Fotydze nominację na stanowisko Szefa Kancelarii Prezydenta RP.

Podczas uroczystości Lech Kaczyński Prezydent RP zwrócił się do zebranych gości:

„Szanowna Pani Minister, Szanowni Państwo, Panie i Panowie Ministrowie i Posłowie.

Jest dla mnie wielkim zaszczytem i przyjemnością powierzyć mojej wieloletniej współpracownicy, jeszcze od czasów Związku Zawodowego „Solidarność”, funkcję Szefa Kancelarii.

Jak Państwo wiecie funkcja ta przez dłuższy czas nie była obsadzona, po odejściu Pana Ministra Szczygło, który bardzo efektywnie sprawował przez wiele miesięcy funkcję Ministra Obrony Narodowej. Pani Minister ma za sobą bardzo istotne doświadczenie i nie mówię tylko o półtorarocznej, bardzo trudnej pracy na stanowisku Ministra Spraw Zagranicznych. Bardzo trudnej nie tylko dlatego, że stanowisko Ministra Spraw Zagranicznych jest w ogóle stanowiskiem trudnym, niezależnie od tego kto je pełni, ale trudnej także dlatego, że na Pani Minister ciążył obowiązek zmiany znacznej ilości wektorów polskiej polityki zagranicznej, zmiany nastawienia Polski do swojej własnej polityki zagranicznej, zmiany w politykę odważniejszą, w sposób bardziej zdecydowany broniącą naszych interesów. Zmiany w politykę, używając sformułowania, którym posługiwał się jeden ze znanych polityków partii dzisiaj rządzącej, chociaż on sam w rządzeniu dzisiaj nie bierze żadnego udziału, mówię o Janie Rokicie, który jeszcze przed rokiem 2005 mówił, że w naszej polityce trzeba przywrócić godność. I ta godność w ciągu ostatnich dwóch lat została przywrócona, a bezpośrednim wykonawcą, jeżeli chodzi o przywrócenie owej godności, w warunkach niezwykle trudnych, w warunkach ciągłych ataków – tych, którym polityka „białej flagi” odpowiadała, bo zaspakajała ich potrzeby, ale co ważniejsze zaspokajała ich interesy, wśród właśnie tych ciągłych ataków Pani Minister to zadanie spokojnie spełniła.

Wcześniej była pierwszym zastępcą, Sekretarzem Stanu w Ministerstwie Spraw Zagranicznych. Też nie był to okres łatwy, ale na szczęście dość krótki. Była też Szefem Departamentu Zagranicznego w Kancelarii Premiera w okresie końcowym, kiedy Prezesem Rady Ministrów był Jerzy Buzek, czyli za rządów AWS-u. Pełniła inne funkcje publiczne, była stałym Wiceprzewodniczącym Rady Nadzorczej Zakładu Ubezpieczeń Społecznych, kierowała Biurem Zagranicznym „Solidarności”. Inaczej mówiąc, ma wiele doświadczeń związanych ze sprawami zagranicznymi, ale nie tylko.

Sądzę, że to zadanie, które ją dzisiaj czeka, wprawdzie też skomplikowane, jest jednak nieco prostsze od dotychczasowych, więc jestem przekonany, że spełni je bez najmniejszego kłopotu. Życzę tego i Tobie, Droga Anno i wszystkim osobom tutaj zgromadzonym, które pracują w Kancelarii, wszystkim pracownikom Kancelarii. Myślę, że Kancelaria, która i tak jest mocna, doznała bardzo istotnego wzmocnienia. Jeszcze raz gratuluję Ci serdecznie.”

Po oficjalnej części uroczystości Anna Fotyga – Szef Kancelarii Prezydenta RP spotkała się z dziennikarzami:

„Obejmuję szefostwo urzędu, który obsługuje Pana Prezydenta. Komórką, która będzie mi bezpośrednio podlegała jest Biuro Spraw Zagranicznych, obsługujące Prezydenta w dziedzinie polityki zagranicznej, bo na pewno Państwo chcielibyście to wiedzieć. Ale zarówno to biuro, jak i wszystkie inne komórki organizacyjne Kancelarii Prezydenta służą przede wszystkim obsłudze administracyjnej działalności Prezydenta. To Pan Prezydent współtworzy politykę zagraniczną, więc chcę jedną rzecz powiedzieć wyraźnie: całym swoim doświadczeniem - bo przecież jest ono dłuższe niż tylko wynikające z mojego doświadczenie ministrowania w rządzie Pana Premiera Jarosława Kaczyńskiego i Pana Premiera Kazimierza Marcinkiewicza - będę służyła wsparciu Prezydenta Rzeczypospolitej.”