Lech Kaczyński podjął w dniu 6 sierpnia 2009 r. decyzję o podpisaniu ustawy o zmianie ustawy o zarządzaniu kryzysowym. Ustawa ta dotyczy niezwykle ważnej kwestii jaką jest sprawne zarządzenie system bezpieczeństwa Rzeczypospolitej Polskiej w sytuacji kryzysowej, m. in. w sytuacji zagrożenia terrorystycznego.
Rozważając kwestie podpisania tej ustawy i przekazania jej do publikacji w Dzienniku Ustaw, Prezydent analizował również wątpliwości podnoszone wobec niektórych przepisów ustawy w toku prac parlamentarnych, a także zgłaszane przez Rzecznika Praw Obywatelskich i przedstawicieli Helsińskiej Fundacji Praw Człowieka.
Zdaniem Pana Prezydenta sprawnie funkcjonujący system zarządzania kryzysowego jest sprawą absolutnie priorytetową, ponieważ zależy od tego skuteczne, nawet w sytuacjach trudnych, działanie struktur organów władzy publicznej, a co najważniejsze bezpieczeństwo obywateli. Jednak nawet ustawa regulująca tak istotne zagadnienia, musi pozostawać w pełnej zgodności z podstawowymi zasadami państwa prawnego, uregulowanymi w przepisach Konstytucji.
Wątpliwości Pana Prezydenta, co do zgodności z Konstytucją, dotyczą m. in. art. 12a ust. 2 i 3. Art. 12a ust. 2 nakłada na szeroki krąg podmiotów obowiązek przekazywania Szefowi Agencji Bezpieczeństwa Wewnętrznego nie tylko informacji o zagrożeniach o charakterze terrorystycznym, lecz również zagrożeniach dotyczących działań, które mogą prowadzić do zagrożenia życia lub zdrowia ludzi, mienia w znacznych rozmiarach, dziedzictwa narodowego lub środowiska. Zdaniem ekspertów sejmowych regulacja zawarta w art. 12a ust. 2 nakłada się na inne rozwiązania prawne, dotyczące informowania organów ścigania o istniejących zagrożeniach dla dóbr, których ochronie ma służyć. W konsekwencji nie jest jasne jakim obowiązkom podlegają adresaci tego przepisu.
Ustawa w art. 12a ust. 3 wprowadza ponadto instytucję zalecenia, które może być udzielone przez Szefa Agencji Bezpieczeństwa Wewnętrznego organom i podmiotom. Tymczasem instytucja zalecenia nie została precyzyjnie określona przez parlament w przedmiotowej ustawie, co może rodzić problemy w przyszłości, w praktyce stosowania ustawy.
Stąd też, mając na względzie istotne znaczenie tej ustawy dla bezpieczeństwa państwa i jego obywateli, a jednocześnie z uwagi na wątpliwości co do zgodności niektórych przepisów z Konstytucją, Prezydent Lech Kaczyński uznał, iż rozwiązaniem właściwym będzie poddanie niektórych przepisów ustawy kontroli przez Trybunał Konstytucyjny po jej opublikowaniu.