8 kwietnia 2000 roku Prezydent Aleksander Kwaśniewski z Małżonką rozpoczął oficjalną wizytę u Jego Świątobliwości Jana Pawła II. Prezydentowi towarzyszą min: minister spraw zagranicznych Bronisław Geremek, p.o. Szefa Kancelarii Prezydenta RP Ryszard Kalisz oraz ambasador przy stolicy Apostolskiej Stefan Frankiewicz. Wizyta rozpoczęła się od ceremonii powitania na dziedzińcu św. Damazego. Polską delegację powitała gwardia szwajcarska, szambelan i orkiestra watykańska. Po zakończeniu ceremonii, w Bibliotece, odbyło się spotkanie " w cztery oczy" papieża Jana Pawła II z prezydentem Aleksandrem Kwaśniewskim. " Wasza Świątobliwość, przywożę najserdeczniejsze pozdrowienia z Polski" - powiedział Prezydent RP witając papieża. Spotkanie trwało około 40 minut. Po rozmowie " w cztery oczy" do biblioteki zaproszeni zostali: Małżonka Prezydenta RP oraz członkowie delegacji. Prezydent Aleksander Kwaśniewski wręczył papieżowi obraz Jerzego Dudy-Gracza zatytułowany "Exodus" z okazji zbliżających się 80-tych urodzin Jana Pawła II. Jolanta Kwaśniewska podarowała Ojcu Świętemu obrazek namalowany przez dzieci chore na białaczkę. Prezydent RP otrzymał w prezencie od papieża płaskorzeźbę w brązie przedstawiającą Chrystusa. Po audiencji prezydent Aleksander Kwaśniewski spotkał się z sekretarzem stanu Stolicy Apostolskiej kardynałem Angelo Sodano. Rozmowa trwała godzinę. Na zakończenie wizyty w Watykanie Prezydent RP odwiedził Bazylikę św. Piotra. Prezydent Aleksander Kwaśniewski pytany przez polskich i włoskich dziennikarzy o przebieg i wrażenia z rozmowy z Janem Pawłem II powiedział m.in.: Oficjalna wizyta w Watykanie była dla mnie wielkim zaszczytem. Miałem okazję rozmawiać z Jego Świątobliwością papieżem Janem Pawłem II. Nasza rozmowa skoncentrowała się wokół spraw polskich, ale także Unii Europejskiej, sąsiadów. Chwilę rozmawialiśmy także o reakcjach na wizytę Ojca Świętego w Palestynie i Izraelu. Mówiłem o tym, że pamiętamy ostatnią pielgrzymkę w kraju, która zapisała się bardzo mocno w naszej świadomości i liczymy, że będziemy mogli gościć papieża ponownie. Złożyłem także Ojcu Świętemu najlepsze życzenia z okazji zbliżających się urodzin. Miałem również okazję pogratulować historycznej, w moim przekonaniu, pielgrzymki do Ziemi Świętej. Jestem przekonany, że ta wizyta Ojca Świętego, którą wspólnie obserwowaliśmy pozostawi ślad zarówno na relacjach pomiędzy Kościołami, ale także odciśnie się mocno na postawach ludzkich. Będzie nas zmuszała do dużo większej otwartości i tolerancji wobec różnorodności, jaką niesie współczesny świat. W czasie spotkania z kardynałem Sodano , w którym uczestniczył również minister spraw zagranicznych Bronisław Geremek, dokonaliśmy przeglądu spraw międzynarodowych, głównie związanych z Unią Europejską i rozszerzaniem. Mówiliśmy także - powiedział Prezydent RP - o sytuacji w regionie i naszych najbliższych sąsiadach. Obie rozmowy - podkreślił Aleksander Kwaśniewski - miały charakter bardzo przyjazny i otwarty. Moja wizyta - powiedział prezydent - jest jakby niekończącym się fragmentem rozmowy między papieżem, kardynałem Sodano, mną i moimi najbliższymi współpracownikami, którą prowadzimy już od kilku lat. A dzisiejsze moje wzruszenia wynikały z możliwości spotkania Ojca Świętego w bardzo dobrej formie. Bardzo energicznego i pełnego werwy. Zawsze spotkanie z tym Wielkim Człowiekiem i Wielkim Polakiem wywołuje wzruszenie, ale także wielką radość. Szczególnym znakiem do podkreślenia dzisiejszej wizyty było to, że mogłem w Watykanie usłyszeć Mazurka Dąbrowskiego, hymnu Rzeczypospolitej Polskiej, co jest przeżyciem zupełnie wyjątkowym, który zapadnie w serce i w pamięć na zawsze - powiedział dziennikarzom polski prezydent. Na pytanie dziennikarzy, jakie dary przywiózł papieżowi i jakie otrzymał od Jego Świątobliwości Aleksander Kwaśniewski odpowiedział: Otrzymałem płaskorzeźbę w brązie Jezusa Zmartwychwstałego, która będzie przekazana do kaplicy pałacowej. Ja podarowałem Ojcu Świętemu obraz, wybitnego, polskiego malarza Jerzego Dudy-Gracza "Exodus", który nawiązuje do treści biblijnych. Moja Małżonka podarowała Ojcu Świętemu obrazek polskiego domu narysowany przez dzieci chore na białaczkę, które dzięki jej Fundacji otrzymują pomoc i wsparcie, a papież tę Fundację swoim listem pobłogosławił jakiś czas temu - powiedział prezydent. Na kolejne pytanie, czy Ojciec Święty odwiedzi Polskę, prezydent opowiedział, że Ojciec Święty powiedział mu "Ale ja już przecież wszędzie byłem". Prezydent podkreślił, że papież jest zawsze otwarty wobec Polski i w Jego oczach widać zawsze tę radość, że w Polsce może spotkać miliony ludzi, którzy tak wiele mu zawdzięczają i którzy są tak mocno z Nim związani. Pytany o szczegóły rozmowy " w cztery oczy" z Janem Pawłem II Aleksander Kwaśniewski uchylił tylko rąbka tajemnicy. Najdłużej mówiliśmy o Unii Europejskiej, o tym jak ważne jest to zadanie dla Polski, jak wiele zależy od zachowania naszych europejskich partnerów. Prezydent podkreślił również, że liczy na to, że sam Ojciec Święty i Watykan pomogą w zrealizowaniu wizji, którą określił przecież papież w 1979 roku. Pamiętajmy - mówił prezydent - że nic jeszcze wówczas nie wskazywało, że mogą się dokonać tak wielkie zmiany, a papież już wówczas mówił, że Europa powinna być zjednoczona. Prezydent Aleksander Kwaśniewski zapytany przez polskich dziennikarzy, czy dzisiejsza wizyta w Watykanie ma jaki jakikolwiek związek z tegoroczną kampanią prezydencką odpowiedział: Z papieżem trzeba rozmawiać na prawdę o wielkich problemach. Z tego wszystkiego, co dziś widać, wynika, że wybory w Polsce nie są żadnym wielkim problemem. W godzinach popołudniowych polski prezydent odwiedził Papieskie Kolegium Polskie na Awentynie. Podczas pobytu w Rzymie prezydent Aleksander Kwaśniewski spotkał się z prezydentem Republiki Włoskiej Carlo Azeglio Ciampim.