Wnioski o nadanie Krzyża Zesłańców Sybiru mają charakter zbiorowy. Prezydent RP Aleksander Kwaśniewski w latach 2004-2005 podjął łącznie 152 postanowienia o nadaniu 31 213 tych Krzyży, a Prezydent RP Lech Kaczyński – 18 postanowień o nadaniu 3 334 Krzyży.

Prezydent RP nadaje Krzyż Zesłańców Sybiru osobom, które:

- były deportowane w latach 1939-1956 na Syberię, do Kazachstanu oraz północnej Rosji i w chwili deportacji posiadały obywatelstwo polskie, a także dzieciom tych osób urodzonym na zesłaniu;

- były więzione w łagrach, obozach i miejscach zsyłek jako obywatele polscy, ale w chwili nadania im Krzyża posiadają obywatelstwo innego państwa.

Krzyż jest nadawany osobom żyjącym w dniu wejścia w życie ustawy, tj. 01 stycznia 2004 r.

Postanowienie o nadaniu Krzyża Prezydent podejmuje na wniosek Ministra Pracy i Polityki Społecznej lub Ministra Spraw Zagranicznych. Ministrowie przedstawiają wnioski z własnej inicjatywy lub z inicjatywy związków i stowarzyszeń kombatanckich. Prowadzenie spraw związanych z procedurą nadawania Krzyża należy  do Urzędu do Spraw Kombatantów i Osób Represjonowanych, nie zaś do zadań Kancelarii Prezydenta RP.

Z inicjatywą w sprawie nadania Krzyża Wojciechowi Jaruzelskiemu wystąpił Zarząd Główny Związku Kombatantów RP i Byłych Więźniów Politycznych. Wniosek został 1 lutego 2006 r. zaakceptowany przez Ministra Pracy i Polityki Społecznej i przekazany do Kancelarii Prezydenta RP za pośrednictwem Urzędu do Spraw Kombatantów i Osób Represjonowanych.

Prezydent Lech Kaczyński wielokrotnie zapowiadał zmianę polityki w zakresie przyznawania orderów i odznaczeń, prowadzonej przez poprzedniego Prezydenta. Zasady te wcielane są w życie.                Pan Prezydent uznał, że najważniejsze tegoroczne odznaczenia powinni otrzymać „cisi bohaterowie” walki o niepodległość ojczyzny z lat 70-tych  i 80-tych. Pan Prezydent zdecydował, że wniosek w sprawie odznaczenia Wojciecha Jaruzelskiego nie będzie rozpatrzony przed 3 maja br.

Pracownicy Kancelarii Prezydenta RP, z wieloletnim w niej stażem,  wbrew woli Prezydenta, a także bez wiedzy i zgody Dyrektora Biura Kadr i Odznaczeń wpisali nazwisko generała na listę odznaczonych (listy  zawierały w sumie nazwiska 1 293 osób) i przekazali do podpisu Prezydentowi. Prezydent akceptował tylko postanowienia, nie zaś listy osób.

 Szef Kancelarii podjął decyzję o wyciągnięciu surowych konsekwencji - przewidzianych Kodeksem pracy- wobec osób, które dopuściły się tak rażącego naruszenia obowiązków służbowych.

Na wszystkich legitymacjach potwierdzających nadanie Krzyża Zesłańców Sybiru stosowane jest faksymile podpisu Prezydenta RP.

Warszawa, dnia 29 marca 2006 r.