Prezydent Rzeczypospolitej Polskiej Lech Kaczyński nadał pośmiertnie Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski Księdzu Janowi Twardowskiemu - za wybitne zasługi w upowszechnianiu humanistycznych wartości, za osiągnięcie w twórczości literackiej.

W nabożeństwie żałobnym w dniu 3 lutego 2006 r. w warszawskim kościele Świętego Krzyża uczestniczyła - w imieniu Prezydenta RP - Podsekretarz stanu w Kancelarii Prezydenta RP Lena Dąbkowska-Cichocka, która przekazała order rodzinie zmarłego.